Ada beberapa maskapai penerbangan yang dilayani di Kantor UPBU Tanjung Harapan. Berikut adalah beberapa maskapai yang dilayani:

1. PT. ASI PUDJIASTUTI AVIATION (SUSI AIR)

Susi Air melayani beberapa rute penerbangan seperti Tanjung Harapan-Long Bawan, Tanjung Harapan-Long Apung, dan Tanjung Harapan-Tarakan. 

2. PT. SMART CAKRAWALA AVIATION (SMART AVIATION)

Maskapai Smart Air melayani rute penerbangan Tanjung Harapan-Long Bawan, Tanjung Harapan-Mahak Baru, Tanjung Harapan-Long Pujungan, Tanjung Harapan-Long Apung, dan Tanjung Harapan-Long Alango.

3. PT. WINGS ABADI (WINGS ABADI AIRLINES)

Saat ini Wings Air di Bandara Tanjung Harapan hanya memiliki rute Tanjung Harapan-Balikpapan. Penambahan rute Tanjung Harapan-Samarinda sedang diusahakan oleh Kepala Kantor UPBU Tanjung Harapan.

4. PESAWAT CARTHER

Pesawat Carther yang dimaksud adalah pesawat yang tidak berjadwal seperti Helicopter TNI/Polri, Pesawat MAF, Pesawat Jet, Pesawat Pengawasan Udara dan pesawat-pesawat yang tidak memiliki kontrak di Bandar Udara Tanjung Harapan.